23 клуби з найвищим коефіцієнтом отримали перепустку до основного раунду, решта 34 стартують у попередньому. Жеребкування обох стадій відбудеться 4 липня у рамках однієї церемонії (початок — о 15.00 за київським часом).

Попередній раунд проходитиме з 27 серпня до 1 вересня. У ньому 34 учасники будуть розділені на сім груп по чотири команди і дві — по три. До основного раунду вийдуть дев'ять переможців груп.

Основний раунд триватиме 8—13 жовтня. Шляхом А підуть переможець попередньої Ліги чемпіонів «Спортинг», перші 11 команд рейтингу УЄФА та клуби, що посідають 16—19-е місця. Саме тут стартуватиме й чемпіон України «Продексім», який наразі утримує 17-у сходинку рейтингу. Команди будуть розподілені на чотири групи, до елітного раунду вийдуть по три найсильніші з кожної. 

Шляхом В пройдуть учасники, що знаходяться в рейтингу УЄФА на 12—15-му та 20—22-му місцях, а також дев'ять переможців груп попереднього раунду. Вони також розділяться на чотири четвірки, переможці яких кваліфікуються до елітного раунду.

В елітному раунді 16 клубів розіб'ють знов-таки на чотири групи, переможці яких отримають перепустку до фінальної частини. Термін проведення еліт-раунду — 19—24 листопада. Жеребкування — 18 жовтня (початок — о 15.00 за київським часом).

Фінальна частина розіграшу Ліги чемпіонів УЄФА з футзалу проходитиме 23—25-го або 24—26 квітня 2020 року на майданчику одного з учасників.