Жереб визначив такі пари учасників 1/4 фіналу:

Львівська область – Закарпатська область

Чернігівська область – Вінницька область

Запорізька область – Кіровоградська область

Сумська область – Харківська область.

Перші матчі чвертьфіналів відбудуться 13 квітня, матчі-відповіді – 20 квітня.

За результатами жеребкування, у першому півфіналі зустрінуться: переможець пари Чернігівська область – Вінницька область та переможець пари Львівська область – Закарпатська область.

У другому півфіналі зіграють: переможець пари Сумська область – Харківська область проти переможця пари Запорізька область – Кіровоградська область.

Перші матчі півфіналів пройдуть 15 травня, повторні зустрічі – 22 травня.

Фінал «Кубку регіонів ФФУ» у 2016 році відбудеться 23 серпня.