Школа створена Комітетом арбітрів ФФУ та уже третій рік функціонує у рамках Конвенції УЄФА з арбітражу, членом якої ФФУ є з 24 січня 2011 року. Свої двері НШФА відкрила у січні 2013 року. В інноваційному для українського футболу проекті взяли участь 34 регіональних школи, які за вказаний період встигли підготувати 1521 спеціаліста з арбітражу.

Починаючи із січня цього року, 19 арбітрів та 13 асистентів випускників НШФА було включено до списку арбітрів змагань U-19 Прем'єр-ліги. Вони отримали дипломи від НШФА за участь у програмі «Молоді таланти 2015», організованою КА ФФУ.